Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms