Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms