Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms