Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms