Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRG1Q02297 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NRG1Q02297 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRG1Q02297 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRG1Q02297 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRG1Q02297 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRG1Q02297 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRG1Q02297 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRG1Q02297 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRG1Q02297 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRG1Q02297 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRG1Q02297 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRG1Q02297 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRG1Q02297 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRG1Q02297 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRG1Q02297 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRG1Q02297 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRG1Q02297 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRG1Q02297 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRG1Q02297 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRG1Q02297 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRG1Q02297 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRG1Q02297 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRG1Q02297 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRG1Q02297 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRG1Q02297 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NRG1Q02297 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRG1Q02297 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms