Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK16Q00536 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK16Q00536 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK16Q00536 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK16Q00536 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK16Q00536 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK16Q00536 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK16Q00536 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK16Q00536 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK16Q00536 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDK16Q00536 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDK16Q00536 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDK16Q00536 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms