Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms