Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD1P98174 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD1P98174 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD1P98174 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD1P98174 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD1P98174 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD1P98174 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD1P98174 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD1P98174 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD1P98174 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD1P98174 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD1P98174 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD1P98174 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD1P98174 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD1P98174 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD1P98174 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD1P98174 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD1P98174 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD1P98174 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD1P98174 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD1P98174 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD1P98174 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD1P98174 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD1P98174 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD1P98174 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD1P98174 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD1P98174 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD1P98174 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD1P98174 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD1P98174 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD1P98174 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD1P98174 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD1P98174 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD1P98174 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD1P98174 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms