Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms