Protein–RNA interactions for Protein: P79483

HLA-DRB3, HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRB3P79483 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DRB3P79483 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms