Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms