Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms