Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP1P53367 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms