Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms