Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms