Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms