Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF5P43026 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF5P43026 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF5P43026 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF5P43026 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF5P43026 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDF5P43026 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF5P43026 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms