Protein–RNA interactions for Protein: P42702

LIFR, Leukemia inhibitory factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIFRP42702 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIFRP42702 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIFRP42702 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIFRP42702 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIFRP42702 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIFRP42702 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIFRP42702 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIFRP42702 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIFRP42702 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIFRP42702 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIFRP42702 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIFRP42702 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIFRP42702 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIFRP42702 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIFRP42702 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIFRP42702 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIFRP42702 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIFRP42702 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIFRP42702 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIFRP42702 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIFRP42702 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIFRP42702 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIFRP42702 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIFRP42702 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIFRP42702 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIFRP42702 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIFRP42702 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIFRP42702 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIFRP42702 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIFRP42702 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIFRP42702 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIFRP42702 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LIFRP42702 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIFRP42702 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LIFRP42702 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIFRP42702 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIFRP42702 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIFRP42702 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIFRP42702 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIFRP42702 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIFRP42702 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIFRP42702 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIFRP42702 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIFRP42702 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIFRP42702 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIFRP42702 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIFRP42702 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIFRP42702 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIFRP42702 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIFRP42702 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIFRP42702 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIFRP42702 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIFRP42702 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIFRP42702 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIFRP42702 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIFRP42702 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIFRP42702 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIFRP42702 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIFRP42702 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LIFRP42702 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIFRP42702 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIFRP42702 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIFRP42702 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIFRP42702 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIFRP42702 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIFRP42702 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIFRP42702 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIFRP42702 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LIFRP42702 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIFRP42702 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LIFRP42702 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIFRP42702 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LIFRP42702 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIFRP42702 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIFRP42702 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIFRP42702 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIFRP42702 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIFRP42702 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIFRP42702 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIFRP42702 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIFRP42702 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIFRP42702 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIFRP42702 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIFRP42702 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LIFRP42702 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIFRP42702 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LIFRP42702 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIFRP42702 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LIFRP42702 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIFRP42702 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LIFRP42702 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIFRP42702 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIFRP42702 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIFRP42702 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIFRP42702 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIFRP42702 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIFRP42702 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIFRP42702 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIFRP42702 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIFRP42702 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms