Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPGP40121 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPGP40121 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPGP40121 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPGP40121 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPGP40121 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPGP40121 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPGP40121 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPGP40121 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPGP40121 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPGP40121 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPGP40121 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPGP40121 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPGP40121 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPGP40121 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPGP40121 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPGP40121 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPGP40121 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPGP40121 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPGP40121 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPGP40121 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPGP40121 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPGP40121 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPGP40121 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPGP40121 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPGP40121 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPGP40121 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPGP40121 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPGP40121 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPGP40121 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPGP40121 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPGP40121 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPGP40121 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPGP40121 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPGP40121 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPGP40121 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPGP40121 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPGP40121 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPGP40121 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPGP40121 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPGP40121 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPGP40121 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPGP40121 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPGP40121 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPGP40121 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPGP40121 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPGP40121 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPGP40121 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPGP40121 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPGP40121 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPGP40121 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPGP40121 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPGP40121 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPGP40121 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPGP40121 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPGP40121 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPGP40121 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPGP40121 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPGP40121 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPGP40121 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPGP40121 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPGP40121 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPGP40121 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPGP40121 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPGP40121 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms