Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms