Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF4P34130 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF4P34130 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF4P34130 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF4P34130 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF4P34130 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF4P34130 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF4P34130 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF4P34130 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF4P34130 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF4P34130 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF4P34130 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF4P34130 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF4P34130 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF4P34130 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF4P34130 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF4P34130 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF4P34130 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF4P34130 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF4P34130 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF4P34130 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF4P34130 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF4P34130 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF4P34130 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF4P34130 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF4P34130 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF4P34130 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF4P34130 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF4P34130 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF4P34130 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF4P34130 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NTF4P34130 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NTF4P34130 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NTF4P34130 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NTF4P34130 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NTF4P34130 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NTF4P34130 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTF4P34130 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTF4P34130 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTF4P34130 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTF4P34130 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTF4P34130 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms