Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA5P28066 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms