Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms