Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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