Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms