Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NME1P15531 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NME1P15531 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NME1P15531 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NME1P15531 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NME1P15531 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NME1P15531 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NME1P15531 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME1P15531 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME1P15531 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME1P15531 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME1P15531 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME1P15531 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME1P15531 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME1P15531 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NME1P15531 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NME1P15531 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME1P15531 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME1P15531 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME1P15531 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME1P15531 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME1P15531 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME1P15531 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME1P15531 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME1P15531 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME1P15531 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME1P15531 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME1P15531 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME1P15531 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME1P15531 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME1P15531 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME1P15531 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NME1P15531 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NME1P15531 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NME1P15531 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NME1P15531 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NME1P15531 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NME1P15531 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NME1P15531 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NME1P15531 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NME1P15531 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NME1P15531 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NME1P15531 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NME1P15531 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NME1P15531 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NME1P15531 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NME1P15531 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NME1P15531 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NME1P15531 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NME1P15531 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NME1P15531 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NME1P15531 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NME1P15531 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NME1P15531 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NME1P15531 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NME1P15531 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NME1P15531 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME1P15531 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME1P15531 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME1P15531 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME1P15531 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME1P15531 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms