Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FDPSP14324 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDPSP14324 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDPSP14324 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDPSP14324 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDPSP14324 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDPSP14324 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDPSP14324 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDPSP14324 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDPSP14324 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDPSP14324 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDPSP14324 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDPSP14324 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDPSP14324 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDPSP14324 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDPSP14324 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDPSP14324 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDPSP14324 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDPSP14324 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDPSP14324 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDPSP14324 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDPSP14324 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDPSP14324 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FDPSP14324 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FDPSP14324 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FDPSP14324 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FDPSP14324 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FDPSP14324 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
FDPSP14324 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FDPSP14324 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FDPSP14324 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FDPSP14324 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FDPSP14324 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FDPSP14324 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FDPSP14324 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FDPSP14324 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FDPSP14324 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FDPSP14324 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FDPSP14324 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FDPSP14324 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FDPSP14324 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FDPSP14324 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FDPSP14324 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FDPSP14324 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FDPSP14324 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FDPSP14324 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FDPSP14324 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FDPSP14324 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FDPSP14324 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDPSP14324 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDPSP14324 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDPSP14324 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDPSP14324 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDPSP14324 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FDPSP14324 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDPSP14324 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDPSP14324 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDPSP14324 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDPSP14324 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDPSP14324 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FDPSP14324 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDPSP14324 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDPSP14324 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDPSP14324 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDPSP14324 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDPSP14324 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDPSP14324 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDPSP14324 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms