Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms