Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms