Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM10L2BP0DMW5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms