Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms