Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms