Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDN1P05305 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDN1P05305 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDN1P05305 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDN1P05305 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDN1P05305 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDN1P05305 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDN1P05305 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDN1P05305 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDN1P05305 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDN1P05305 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDN1P05305 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDN1P05305 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDN1P05305 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDN1P05305 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EDN1P05305 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDN1P05305 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDN1P05305 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDN1P05305 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDN1P05305 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDN1P05305 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDN1P05305 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDN1P05305 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EDN1P05305 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDN1P05305 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDN1P05305 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDN1P05305 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDN1P05305 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDN1P05305 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDN1P05305 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDN1P05305 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDN1P05305 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDN1P05305 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDN1P05305 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms