Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFNA4P05014 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms