Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC1P02654 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
APOC1P02654 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms