Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOA1P02647 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOA1P02647 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOA1P02647 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOA1P02647 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOA1P02647 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOA1P02647 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOA1P02647 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOA1P02647 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOA1P02647 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOA1P02647 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOA1P02647 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOA1P02647 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOA1P02647 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOA1P02647 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOA1P02647 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOA1P02647 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOA1P02647 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOA1P02647 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOA1P02647 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOA1P02647 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOA1P02647 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOA1P02647 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOA1P02647 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOA1P02647 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOA1P02647 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOA1P02647 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOA1P02647 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOA1P02647 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOA1P02647 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOA1P02647 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOA1P02647 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOA1P02647 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOA1P02647 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms