Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms