Protein–RNA interactions for Protein: P01229

LHB, Lutropin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHBP01229 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHBP01229 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHBP01229 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHBP01229 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHBP01229 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHBP01229 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHBP01229 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHBP01229 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHBP01229 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHBP01229 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHBP01229 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHBP01229 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHBP01229 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHBP01229 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms