Protein–RNA interactions for Protein: O60284

ST18, Suppression of tumorigenicity 18 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST18O60284 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ST18O60284 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ST18O60284 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ST18O60284 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ST18O60284 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST18O60284 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST18O60284 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST18O60284 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST18O60284 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST18O60284 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST18O60284 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST18O60284 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST18O60284 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST18O60284 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST18O60284 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST18O60284 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST18O60284 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST18O60284 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST18O60284 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST18O60284 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST18O60284 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ST18O60284 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST18O60284 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST18O60284 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST18O60284 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST18O60284 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST18O60284 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST18O60284 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST18O60284 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST18O60284 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST18O60284 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST18O60284 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST18O60284 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST18O60284 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST18O60284 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST18O60284 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ST18O60284 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST18O60284 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST18O60284 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST18O60284 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST18O60284 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST18O60284 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ST18O60284 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ST18O60284 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ST18O60284 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST18O60284 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST18O60284 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST18O60284 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST18O60284 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST18O60284 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST18O60284 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST18O60284 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST18O60284 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST18O60284 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST18O60284 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST18O60284 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST18O60284 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST18O60284 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST18O60284 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST18O60284 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST18O60284 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST18O60284 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST18O60284 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST18O60284 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST18O60284 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST18O60284 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST18O60284 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST18O60284 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST18O60284 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST18O60284 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST18O60284 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST18O60284 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST18O60284 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST18O60284 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST18O60284 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST18O60284 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST18O60284 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST18O60284 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST18O60284 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST18O60284 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST18O60284 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST18O60284 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ST18O60284 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ST18O60284 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ST18O60284 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ST18O60284 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ST18O60284 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ST18O60284 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ST18O60284 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ST18O60284 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ST18O60284 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ST18O60284 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ST18O60284 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ST18O60284 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ST18O60284 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ST18O60284 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ST18O60284 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ST18O60284 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ST18O60284 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ST18O60284 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms