Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLIN1O60240 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLIN1O60240 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLIN1O60240 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLIN1O60240 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLIN1O60240 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLIN1O60240 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLIN1O60240 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLIN1O60240 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms