Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms