Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APAF1O14727 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APAF1O14727 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APAF1O14727 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APAF1O14727 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APAF1O14727 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APAF1O14727 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APAF1O14727 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APAF1O14727 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
APAF1O14727 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APAF1O14727 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APAF1O14727 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
APAF1O14727 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APAF1O14727 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APAF1O14727 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APAF1O14727 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APAF1O14727 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APAF1O14727 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APAF1O14727 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APAF1O14727 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APAF1O14727 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APAF1O14727 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APAF1O14727 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APAF1O14727 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APAF1O14727 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APAF1O14727 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APAF1O14727 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APAF1O14727 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APAF1O14727 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APAF1O14727 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APAF1O14727 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APAF1O14727 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APAF1O14727 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APAF1O14727 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APAF1O14727 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APAF1O14727 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APAF1O14727 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APAF1O14727 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
APAF1O14727 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
APAF1O14727 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
APAF1O14727 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APAF1O14727 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APAF1O14727 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APAF1O14727 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
APAF1O14727 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APAF1O14727 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APAF1O14727 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APAF1O14727 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APAF1O14727 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APAF1O14727 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APAF1O14727 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APAF1O14727 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APAF1O14727 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APAF1O14727 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APAF1O14727 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APAF1O14727 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APAF1O14727 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APAF1O14727 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
APAF1O14727 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APAF1O14727 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APAF1O14727 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APAF1O14727 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APAF1O14727 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms