Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIP1O00291 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HIP1O00291 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIP1O00291 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIP1O00291 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIP1O00291 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIP1O00291 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIP1O00291 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIP1O00291 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIP1O00291 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIP1O00291 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIP1O00291 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIP1O00291 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIP1O00291 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIP1O00291 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIP1O00291 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIP1O00291 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIP1O00291 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIP1O00291 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIP1O00291 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIP1O00291 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIP1O00291 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HIP1O00291 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIP1O00291 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HIP1O00291 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIP1O00291 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIP1O00291 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIP1O00291 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIP1O00291 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIP1O00291 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIP1O00291 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIP1O00291 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIP1O00291 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIP1O00291 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIP1O00291 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIP1O00291 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIP1O00291 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIP1O00291 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIP1O00291 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIP1O00291 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIP1O00291 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIP1O00291 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIP1O00291 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIP1O00291 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIP1O00291 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HIP1O00291 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HIP1O00291 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIP1O00291 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIP1O00291 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIP1O00291 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIP1O00291 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIP1O00291 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIP1O00291 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIP1O00291 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIP1O00291 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIP1O00291 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIP1O00291 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIP1O00291 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIP1O00291 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIP1O00291 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIP1O00291 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIP1O00291 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIP1O00291 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIP1O00291 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HIP1O00291 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIP1O00291 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIP1O00291 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIP1O00291 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIP1O00291 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIP1O00291 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIP1O00291 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIP1O00291 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIP1O00291 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HIP1O00291 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIP1O00291 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIP1O00291 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIP1O00291 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIP1O00291 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HIP1O00291 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIP1O00291 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HIP1O00291 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIP1O00291 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIP1O00291 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIP1O00291 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIP1O00291 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIP1O00291 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIP1O00291 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIP1O00291 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIP1O00291 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIP1O00291 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIP1O00291 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIP1O00291 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIP1O00291 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIP1O00291 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIP1O00291 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIP1O00291 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HIP1O00291 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIP1O00291 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIP1O00291 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIP1O00291 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms