Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN8O00124 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN8O00124 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN8O00124 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN8O00124 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN8O00124 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN8O00124 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN8O00124 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN8O00124 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN8O00124 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN8O00124 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN8O00124 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN8O00124 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN8O00124 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN8O00124 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN8O00124 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN8O00124 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN8O00124 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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