Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
E9PCH4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
E9PCH4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
E9PCH4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
E9PCH4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
E9PCH4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
E9PCH4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
E9PCH4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PCH4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PCH4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PCH4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PCH4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PCH4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PCH4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PCH4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PCH4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PCH4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PCH4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PCH4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PCH4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PCH4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PCH4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PCH4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PCH4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PCH4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PCH4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PCH4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PCH4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PCH4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PCH4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PCH4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PCH4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PCH4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PCH4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
E9PCH4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
E9PCH4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
E9PCH4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
E9PCH4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
E9PCH4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
E9PCH4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
E9PCH4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
E9PCH4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
E9PCH4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
E9PCH4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
E9PCH4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
E9PCH4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
E9PCH4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
E9PCH4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
E9PCH4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
E9PCH4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
E9PCH4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
E9PCH4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
E9PCH4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
E9PCH4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
E9PCH4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
E9PCH4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
E9PCH4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
E9PCH4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
E9PCH4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
E9PCH4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
E9PCH4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
E9PCH4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
E9PCH4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
E9PCH4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
E9PCH4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
E9PCH4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
E9PCH4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
E9PCH4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
E9PCH4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
E9PCH4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
E9PCH4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
E9PCH4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
E9PCH4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
E9PCH4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
E9PCH4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
E9PCH4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
E9PCH4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
E9PCH4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
E9PCH4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
E9PCH4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
E9PCH4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
E9PCH4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PCH4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PCH4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PCH4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PCH4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PCH4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PCH4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PCH4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PCH4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PCH4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PCH4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PCH4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PCH4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PCH4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PCH4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PCH4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PCH4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PCH4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PCH4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms