Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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