Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms