Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC169A6NNP5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms