Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
TTLL13PA6NNM8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms