Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms